A partir de febrero del 2000, se obtuvo la certificación del Sistema de Aseguramiento de Calidad  CIDETEQ conforme a la Norma NMX-CC-004:1995 IMNC / ISO 9002:1994.  En marzo del 2004 se obtuvo la certificación del Sistema de Administración de la calidad conforme a la Norma ISO 9001:2000. Actualmente se tiene la Certificación del Sistema de Gestión de la Calidad conforme a la Norma NMX-CC-9001-IMNC-2008, cuyo alcance es:

• PROYECTOS (Investigación y Desarrollo Tecnológico)
• SERVICIOS TECNOLÓGICOS (Análisis Químico, Información y caracterización de materiales y corrosión); y
• FORMACIÓN DE RECURSOS HUMANOS

Tanto las acreditaciones como la certificación del sistema de gestión de la calidad ha sido posible gracias a la participación de todo el personal, personal que comparte la misión, visión, política de calidad y valores del CIDETEQ.